检察院不起诉后什么时候能申请港澳通行证？

首先，我们来了解一下港澳通行证的相关规定。港澳通行证是内地居民前往香港、澳门地区的通行证件，申请港澳通行证本身有一套规定的流程和条件。

根据《中国公民因私事往来香港地区或者澳门地区的暂行管理办法》，内地公民因私事前往香港、澳门，须向户口所在地的市、县公安局出入境管理部门提出申请。在申请条件方面，并没有明确规定检察院不起诉的人员不能申请港澳通行证。

检察院不起诉，是指人民检察院在审查起诉后做出不将案件移送人民法院审判而终止诉讼的决定。这通常意味着当事人不会被追究刑事责任。一般情况下，只要不存在其他不符合申请港澳通行证的情形，比如被限制出境等，在检察院做出不起诉决定后，当事人随时都可以申请港澳通行证。

所谓限制出境的情形，可能包括未了结的民事案件，人民法院决定不准出境的；被判处刑罚尚未执行完毕或者属于刑事案件被告人、犯罪嫌疑人的等情况。但既然检察院已经做出了不起诉决定，通常就不属于刑事案件被告人、犯罪嫌疑人了。

所以，只要当事人满足申请港澳通行证的基本条件，如持有有效的居民身份证等，在准备好相关材料后，就可以前往当地的出入境管理部门申请港澳通行证。