办理食品许可证是由哪个部门负责？

办理食品许可证主要由市场监督管理部门负责。食品许可证是从事食品销售和餐饮服务活动的商家必须取得的证件，它是保障食品安全、规范食品经营市场的重要手段。

根据《食品经营许可管理办法》第二条规定，在中华人民共和国境内，从事食品销售和餐饮服务活动，应当依法取得食品经营许可。同时，该办法第六条明确指出，国家食品药品监督管理总局负责监督指导全国食品经营许可管理工作。县级以上地方食品药品监督管理部门负责本行政区域内的食品经营许可管理工作。虽然目前食品药品监督管理部门的相关职能已整合到市场监督管理部门，但法律规定的职能依然有效，所以现在是由各地的市场监督管理部门来具体执行食品许可证的办理工作。

商家在办理食品许可证时，需要按照市场监督管理部门的要求，提交相关的申请材料，包括申请书、主要设备设施布局、操作流程等文件。市场监督管理部门会对提交的材料进行审核，并对经营场所进行实地核查。如果材料和实地情况都符合食品安全标准和要求，就会核发食品许可证。