特别行政区设立的司法机关有初级法院吗？

特别行政区由于实行高度自治，其司法制度具有一定的特殊性，不同特别行政区的司法机关设置情况存在差异。

以香港特别行政区为例，香港的司法机关体系中并没有传统意义上被称为“初级法院”的设置。香港特别行政区的主要司法机关包括终审法院、高等法院（高等法院又分为上诉法庭和原讼法庭）、区域法院、裁判法院以及其他专门法庭。裁判法院主要负责审理较轻微的刑事案件，从职能上看有点类似初级的司法审判机构，但它并不叫初级法院。根据《中华人民共和国香港特别行政区基本法》第八十一条规定，香港特别行政区设立终审法院、高等法院、区域法院、裁判署法庭和其他专门法庭。高等法院设上诉法庭和原讼法庭。这就从法律层面确定了香港司法机关的设置架构。

而澳门特别行政区的司法机关体系中存在初级法院。澳门的初级法院是其司法组织中的基层审判机构，负责审理一般的民事和刑事案件。依据《中华人民共和国澳门特别行政区基本法》第八十四条规定，澳门特别行政区设立初级法院、中级法院和终审法院。初级法院可根据需要设立若干专门法庭。

综上所述，特别行政区是否设立初级法院不能一概而论，香港特别行政区没有初级法院的设置，而澳门特别行政区则有初级法院。