纳税人认为税务机关有失公平由谁来举证？

在纳税人认为税务机关有失公平的情况下，举证责任的分配需要依据具体情况和相关法律规定来确定。

首先，我们来了解一下行政诉讼中的举证责任分配原则。根据《中华人民共和国行政诉讼法》第三十四条规定，被告对作出的行政行为负有举证责任，应当提供作出该行政行为的证据和所依据的规范性文件。也就是说，当纳税人对税务机关的行政行为提起行政诉讼时，税务机关作为被告，需要对其作出的行政行为的合法性承担举证责任。比如，税务机关作出了一项征税决定，那么它就需要证明该决定是有事实依据和法律依据的，像提供纳税人的纳税记录、适用的税收法规等证据。

然而，在某些特定情形下，纳税人也可能需要承担一定的举证责任。比如，纳税人提出了一些特殊的主张，像自己存在符合税收减免政策的情况，那么就需要纳税人自己提供相关的证据来证明。这是因为只有纳税人自己最清楚自身的实际情况，也更容易获取相关证据。例如，纳税人声称自己符合某项环保税收优惠政策，就需要提供企业的环保设备购置发票、环保达标检测报告等证据来支持自己的主张。

此外，如果涉及到税务机关对纳税人进行处罚的案件，纳税人如果认为处罚过重或者不合理，在反驳税务机关的处罚依据时，也需要提供相应的证据来支持自己的观点。比如，税务机关以纳税人未按时申报纳税进行处罚，纳税人若称是因为不可抗力因素导致未能按时申报，就需要提供诸如自然灾害证明、政府部门通知等相关证据。

综上所述，一般情况下税务机关对其行政行为合法性承担举证责任，但纳税人在提出特殊主张或反驳税务机关观点时，也需承担相应的举证责任。