总公司能否给分公司合作费开发票？

在法律层面，总公司能否给分公司合作费开发票，需要分情况来看。

首先，我们要明确分公司的法律地位。分公司不具有独立法人资格，它是总公司的分支机构。但在税务处理上，分公司通常是独立进行税务登记并纳税的。

根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。这里的关键在于判断总公司和分公司之间的合作是否属于“对外发生经营业务”。

如果总公司和分公司之间的合作是相互独立核算的，且这种合作是基于真实的业务往来，例如总公司为分公司提供了特定的服务或者产品，那么总公司可以给分公司就合作费开具发票。这是因为此时双方的交易类似于两个独立经营主体之间的业务往来，符合开具发票的条件。

然而，如果总公司和分公司之间的资金往来只是内部的资金调配，并非基于真实的经营业务，那么就不能开具发票。例如，总公司只是将资金划拨给分公司用于日常运营，这不属于经营业务的范畴，开具发票就不符合规定。

在实际操作中，要确保业务的真实性和合法性，并且严格按照税务法规进行发票的开具和管理。同时，建议企业在处理这类问题时，咨询专业的税务顾问或者向当地税务机关进行详细咨询，以避免税务风险。