涉税专业机构能否向税务机关提出异议？

涉税专业机构是有权利向税务机关提出异议的。

从法律角度来看，这涉及到行政相对人的权利保障问题。行政相对人，在这里就是涉税专业机构，在认为行政机关（税务机关）的行政行为侵犯其合法权益时，有权利通过合法途径表达自己的意见和诉求。依据《中华人民共和国税收征收管理法》第八条规定，纳税人、扣缴义务人对税务机关所作出的决定，享有陈述权、申辩权；依法享有申请行政复议、提起行政诉讼、请求国家赔偿等权利。这表明，涉税专业机构作为与税务事项密切相关的主体，同样享有这些基本权利，向税务机关提出异议就是行使陈述权和申辩权的一种体现。

当涉税专业机构向税务机关提出异议时，一般可以按照以下步骤进行。首先，准备充分的证据材料，证明自己的业务处理是符合法律法规和相关规定的。这些证据可以包括合同、发票、会计凭证等。然后，以书面形式向税务机关提交异议申请，在申请中清晰地阐述异议的事项、理由以及所依据的法律法规。税务机关在收到申请后，会根据具体情况进行调查核实。如果经过调查，税务机关认为异议成立，就会对原处理决定进行调整；如果认为异议不成立，会向涉税专业机构说明理由。

如果涉税专业机构对税务机关针对异议的处理结果仍然不满意，还可以进一步通过行政复议或者行政诉讼等途径来维护自己的合法权益。行政复议是向作出具体行政行为的税务机关的上一级机关提出重新审查的申请；行政诉讼则是向人民法院提起诉讼，由法院对税务机关的行政行为进行司法审查。