法院会判决协议离婚子女抚养权吗？

在协议离婚的过程中，如果双方就子女抚养权问题产生争议，无法达成一致协议时，法院是会对子女抚养权进行判决的。

协议离婚通常是夫妻双方自愿达成离婚的共识，并就子女抚养、财产分割等事项协商一致后，到婚姻登记机关办理离婚登记。然而，当双方在子女抚养权方面无法协商一致时，就不能单纯通过协议离婚的方式解决这一问题了。此时，若一方或双方希望解决子女抚养权归属，就需要向法院提起离婚诉讼。

根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条规定，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。

法院在判决子女抚养权时，会综合考虑各种因素，以确保判决结果符合未成年子女的最大利益。这些因素包括但不限于双方的经济状况、生活环境、教育背景、与子女的感情亲疏等。例如，如果一方有稳定的收入、良好的居住条件和教育资源，能够为子女提供更好的生活和成长环境，那么在抚养权争夺中可能会更有优势。同时，如果子女已经年满八周岁，法院会充分尊重子女自己的意愿。