自建房有房产证但地基不是自己的能过户吗？

首先，我们来了解几个关键的法律概念。自建房就是自己组织建造的房屋，房产证是房屋产权的合法凭证，证明你对房屋拥有所有权；而地基一般涉及土地使用权。

在我国，土地的所有权分为国家所有和集体所有。如果地基是集体土地，通常宅基地的使用权是分配给本集体经济组织成员的。根据《中华人民共和国民法典》第三百六十三条规定，宅基地使用权的取得、行使和转让，适用土地管理的法律和国家有关规定。《中华人民共和国土地管理法》也明确了农村宅基地的相关规定，宅基地的转让有严格的限制条件，一般只能在本集体经济组织内部成员之间流转。

对于自建房有房产证但地基不是自己的情况，如果地基是集体土地且你不是该集体组织成员，那么过户是存在很大障碍的。因为这种情况下，你不具备该宅基地的合法使用权，不符合宅基地转让的条件。即便房屋有房产证，没有合法的地基使用权，房屋的过户手续也难以完成。

如果地基是国有土地，虽然相对集体土地限制少一些，但也需要符合相关的法律法规和政策要求。例如，土地的出让、划拨等情况不同，对房屋过户的规定也不同。如果土地使用性质等方面存在问题，同样可能导致无法过户。

所以，自建房有房产证但地基不是自己的，通常不能顺利过户。建议你先确认地基的性质和相关权益情况，再到当地的不动产登记部门咨询具体的过户政策和手续。