公安机关、国家安全机关和有关部门应当怎么做？

在我国法律体系中，公安机关、国家安全机关和有关部门承担着维护国家安全、社会稳定和保障公民合法权益等重要职责。

从维护国家安全层面来看，根据《中华人民共和国国家安全法》规定，国家安全机关是国家安全工作的主管机关，负责收集涉及国家安全的情报信息，开展国家安全审查和监管工作，依法开展国家安全专门工作等。公安机关在维护国家安全工作中也承担着重要职责，要与国家安全机关密切配合，共同防范、制止和惩治危害国家安全的违法犯罪活动。

在社会治安管理方面，依据《中华人民共和国治安管理处罚法》，公安机关负责维护社会治安秩序，保障公共安全，保护公民、法人和其他组织的合法权益。他们要对扰乱公共秩序、妨害公共安全、侵犯人身权利、财产权利、妨害社会管理等具有社会危害性的行为进行查处。

在应急处置方面，依据《中华人民共和国突发事件应对法》等相关法律，公安机关、国家安全机关和有关部门应当建立健全突发事件应急机制，做好突发事件的预防与应急准备、监测与预警、应急处置与救援、事后恢复与重建等工作，以保障人民群众的生命财产安全和社会的稳定运行。

此外，这些机关和部门还应当依法保障公民的基本权利和自由，在执法过程中严格遵循法定程序，做到公正、文明执法。例如，在进行调查取证、采取强制措施等活动时，必须符合《中华人民共和国刑事诉讼法》等法律的规定，切实保护公民的合法权益不受侵犯。