公司获得免税资格后员工工资可以抵扣吗？

首先，我们来了解一下几个关键概念。免税资格是指公司依据国家相关税收政策，在一定范围内可以不用缴纳某些税款。而工资抵扣，通常指的是企业在计算应纳税所得额时，将支付给员工的工资作为成本费用进行扣除，从而减少应纳税的金额。

根据我国《企业所得税法》第八条规定，企业实际发生的与取得收入有关的、合理的支出，包括成本、费用、税金、损失和其他支出，准予在计算应纳税所得额时扣除。其中，工资薪金支出属于企业的合理费用支出范畴。这里所说的工资薪金，是指企业每一纳税年度支付给在本企业任职或者受雇的员工的所有现金形式或者非现金形式的劳动报酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴、年终加薪、加班工资，以及与员工任职或者受雇有关的其他支出。

公司获得免税资格，一般是针对特定税种或特定业务而言的，并不意味着所有税收相关的规定都不再适用。即使公司在某些方面获得了免税资格，但在计算企业所得税时，员工工资作为企业的正常经营成本，依然是可以按照规定进行税前扣除的。也就是说，企业可以将支付给员工的合理工资从收入中扣除，以计算应纳税所得额。这样做的目的是为了准确反映企业的真实经营成本和利润情况，避免对企业的正常经营成本进行重复征税。

不过，这里的工资扣除需要满足一定条件。一是工资必须是实际发生的，企业需要有相关的支付凭证，如工资发放表、银行转账记录等，来证明工资已经实际支付给员工。二是工资要合理，即符合行业的一般水平和企业的实际经营情况。如果企业支付的工资明显高于同行业水平，且没有合理的理由，税务机关可能会对其进行调整。所以，公司获得免税资格后，员工工资通常是可以在计算企业所得税时进行抵扣的，但要符合上述相关规定。