犯罪嫌疑人不认罪认罚时起诉意见书该如何处理？

在法律程序中，起诉意见书是公安机关对侦查终结的案件，认为犯罪事实清楚，证据确实、充分，依法应当追究犯罪嫌疑人刑事责任的，提请同级人民检察院审查决定时制作的法律文书。

当犯罪嫌疑人不认罪认罚时，公安机关在起诉意见书中仍需如实记录犯罪嫌疑人的犯罪事实、证据情况以及其不认罪认罚的态度。根据《公安机关办理刑事案件程序规定》，公安机关制作起诉意见书时，应当做到犯罪事实清楚，证据确实、充分。这意味着即使犯罪嫌疑人不认罪，只要有足够的证据证明其犯罪行为，公安机关依然会在起诉意见书中明确指控。

对于不认罪认罚的情况，并不会影响司法机关根据证据和法律进行处理。《中华人民共和国刑事诉讼法》规定，没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。证据确实、充分，应当符合以下条件：定罪量刑的事实都有证据证明；据以定案的证据均经法定程序查证属实；综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。

从犯罪嫌疑人自身角度来看，不认罪认罚可能会失去一些从宽处理的机会。认罪认罚从宽制度是我国刑事诉讼中的一项重要制度，犯罪嫌疑人自愿如实供述自己的罪行，承认指控的犯罪事实，愿意接受处罚的，可以依法从宽处理。但如果犯罪嫌疑人认为自己确实无罪而不认罪认罚，这也是其行使辩护权利的表现。在后续的司法程序中，犯罪嫌疑人可以通过委托辩护人等方式，依法进行辩护，维护自己的合法权益。