农民在荒地上盖房子后被流转是否违法？

首先，我们来看看农民在荒地上盖房子这个行为。一般来说，农村的土地分为农用地、建设用地等不同类型。荒地如果属于农用地，想要在上面盖房子，需要经过合法的审批手续将农用地转为建设用地。

根据《土地管理法》第四十四条规定，建设占用土地，涉及农用地转为建设用地的，应当办理农用地转用审批手续。如果农民未经审批就在荒地上盖房子，那这个建房行为本身可能就是违法的，所建的房屋可能会被认定为违建。

接着说土地流转的问题。土地流转是指土地使用权流转，即拥有土地承包经营权的农户将土地经营权（使用权）转让给其他农户或经济组织。如果荒地的流转是符合法定程序和规定的，比如签订了合法有效的流转合同，流转双方具有相应的民事行为能力，流转的内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗等，那么土地流转本身是合法的。

但是，如果建房行为违法，且流转涉及到了违法建设的房屋，这就会比较复杂。因为违法建设的房屋可能会影响到土地流转的效力和后续使用。在这种情况下，流转行为可能会因为存在违法因素而面临一些法律风险和不确定性。比如，相关部门可能会对违法建筑进行拆除，这可能会导致流转的目的无法实现，给流转双方带来损失。所以，农民在荒地上盖房子后被流转是否违法，要综合建房的合法性以及流转程序的合法性来判断。