实习三个月上班一年后公司要扣掉实习补贴，这合法吗？

首先，我们来明确一下实习补贴的性质。实习补贴通常是公司给予实习生在实习期间的一种经济补偿，用于补贴实习生在实习过程中的一些费用支出等。这可以看作是双方达成的一种约定，有点像一种“君子协定”，虽然可能不像正式劳动合同那么严谨，但也是有一定效力的。

从法律层面来看，如果公司和你在实习期间有关于实习补贴的明确约定，无论是书面协议还是口头承诺，公司都应该按照约定来执行。根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条规定，当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。书面形式是合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，视为书面形式。也就是说，不管是书面还是口头的约定，只要能证明其存在，就具有法律效力。

在你这种情况下，你已经实习结束并且正式入职工作了一年，这时候公司突然要扣掉实习补贴，这很可能违反了当初的约定。除非公司能够证明存在合理的扣除理由，比如你在实习期间有严重违反公司规章制度、给公司造成重大损失等情况，并且在之前的约定中有明确说明出现这些情况公司有权扣除补贴。

如果公司没有合理理由就擅自扣除实习补贴，你可以采取一些措施维护自己的权益。你可以先和公司进行友好沟通，了解公司扣除补贴的原因，并要求公司按照约定支付补贴。如果沟通无果，你可以向劳动监察部门投诉，他们会对公司的行为进行调查和处理。也可以收集相关证据，比如实习协议、工资条、聊天记录等，向劳动争议仲裁机构申请仲裁。如果对仲裁结果不满意，还可以向人民法院提起诉讼。