员工违反公司制度罚款是否合法？

员工违反公司制度，公司对其罚款是否合法需要分情况来看。

首先，要理解“罚款”在法律层面的含义。罚款通常是一种行政处罚手段，一般由具有行政处罚权的行政机关来行使。在企业和员工的关系中，企业并不是行政机关，本身并没有行政处罚权。从这个基本概念来讲，公司直接对员工进行罚款这种行为在法律上是没有天然的正当性的。

但是，根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条规定，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。如果公司的规章制度是依法制定的，即经过了民主程序，内容合法且向员工进行了公示，并且规章制度中明确规定了员工违反某些制度时，公司可以采取扣除绩效奖金、影响年终评优等类似经济方面的惩戒措施，那么这种情况下公司按照规章制度对员工进行处理就是合法的。

比如，公司的制度经过了全体职工讨论，并且在公司内部显著位置进行了公示，员工也都知晓。制度里规定如果员工无故迟到多次，会扣除相应的绩效奖金。当员工确实出现了无故多次迟到的情况，公司扣除其绩效奖金就不属于违法的罚款行为。但如果公司没有经过合法的程序制定制度，或者制度本身不合法，却随意对员工进行罚款，那么员工可以通过合法途径维护自己的权益，比如向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁。总之，判断公司对员工因违反制度进行的经济惩戒是否合法，关键在于制度的制定和执行是否符合法律规定。