检察院认为事实不清证据不足会怎样处理？

当检察院认为案件事实不清、证据不足时，在不同的诉讼阶段会有不同的处理方式。

在审查逮捕阶段，如果检察院认为事实不清、证据不足，不符合逮捕条件的，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第九十一条规定，人民检察院应当作出不批准逮捕的决定。公安机关应当在接到通知后立即释放被拘留的人，并且将执行情况及时通知人民检察院。这是因为逮捕是一种较为严厉的强制措施，必须要有足够的证据证明犯罪嫌疑人有犯罪事实，可能判处徒刑以上刑罚，采取取保候审尚不足以防止发生社会危险性等条件。

在审查起诉阶段，检察院可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。依据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十五条，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院重新计算审查起诉期限。如果经过二次补充侦查，仍然证据不足，不符合起诉条件的，人民检察院应当作出不起诉的决定。这种不起诉被称为存疑不起诉，意味着在现有证据情况下，无法认定犯罪嫌疑人有罪。

对于被不起诉人，如果在押，应当立即释放。而且，根据《中华人民共和国国家赔偿法》的相关规定，如果被错误羁押，被不起诉人还有权申请国家赔偿。总之，检察院认为事实不清、证据不足时，会严格按照法律规定的程序进行处理，以保障犯罪嫌疑人的合法权益和司法的公正。