房地产发生退房，已经预缴的税款怎么办？

在房地产交易中，当发生退房情况时，已经预缴的税款处理方式需要依据不同税种来看。

首先是增值税。根据《财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016〕36号）相关规定，如果是房地产开发企业销售自行开发的房地产项目，纳税人适用一般计税方法计税的，按照取得的全部价款和价外费用，扣除当期销售房地产项目对应的土地价款后的余额计算销售额。若发生退房，已预缴的增值税可抵减纳税人以后应缴纳的增值税税款；若抵减不完的，可以申请退税。

其次是土地增值税。根据土地增值税相关规定，房地产开发企业在项目全部竣工结算前转让房地产取得的收入，由于涉及成本确定或其他原因，而无法据以计算土地增值税的，可以预征土地增值税，待该项目全部竣工、办理结算后再进行清算，多退少补。当发生退房时，如果还未完成土地增值税清算，已预缴的土地增值税可在后续清算时进行相应调整；如果已经完成清算，按照实际情况多退少补。

再者是企业所得税。房地产开发企业通过正式签订《房地产销售合同》或《房地产预售合同》所取得的收入，应确认为销售收入的实现。当发生退房时，企业应冲减当期的销售收入和销售成本等。已预缴的企业所得税，会在企业进行年度汇算清缴时进行调整，多缴的税款可以申请退税或者抵减下期应纳税款。

购房者个人方面，如果是个人购买住房后发生退房，涉及契税的，根据《财政部 国家税务总局关于购房人办理退房有关契税问题的通知》规定，对已缴纳契税的购房单位和个人，在未办理房屋权属变更登记前退房的，退还已纳契税；在办理房屋权属变更登记后退房的，不予退还已纳契税。 总之，房地产发生退房后预缴税款的处理，要区分不同税种和具体情况，按照相关税收法规进行操作。