合作协议能进行劳动仲裁吗

合作协议能否进行劳动仲裁，需要分情况来看。

首先，劳动仲裁主要处理的是用人单位与劳动者之间的劳动争议。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条规定，中华人民共和国境内的用人单位与劳动者发生的下列劳动争议，适用本法： （一）因确认劳动关系发生的争议； （二）因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议； （三）因除名、辞退和辞职、离职发生的争议； （四）因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议； （五）因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议； （六）法律、法规规定的其他劳动争议。

如果合作协议仅仅是关于双方在商业合作、项目合作等方面的约定，不涉及劳动权利义务关系，那么就不能通过劳动仲裁来解决纠纷，而应根据协议的具体性质和约定，通过民事仲裁或向法院提起民事诉讼等途径来处理。比如，双方签订的合作协议只是关于共同投资一个项目，约定了出资比例、利润分配等商业合作条款，这种情况下出现纠纷就不能进行劳动仲裁。

但要是合作协议中涉及到劳动权利义务关系，例如双方约定了劳动报酬、工作时间、休息休假等内容，且一方认为另一方违反了这些约定，那么可以向劳动仲裁机构申请仲裁。举个例子，合作协议里约定一方按照固定工作时间为另一方工作，并明确了劳动报酬的计算方式等，若出现报酬支付等问题，就有可能适用劳动仲裁。

另外，即便签的是合作协议，只要在实际操作中有劳动关系的迹象，比如员工受雇主管理、领薪水等，那这种关系就应算作劳动关系。在此前提下，若出现劳资纠纷，如薪酬、工伤赔偿等问题，仲裁机构应该受理。

相关概念：

劳动仲裁：是指由劳动争议仲裁委员会对当事人申请仲裁的劳动争议居中公断与裁决。

劳动关系：是指用人单位与劳动者之间，依法所确立的劳动过程中的权利义务关系。

民事仲裁：是双方当事人根据事先或事后达成的仲裁协议，自愿将其争议提交给仲裁机构进行裁决的一种争议解决方式。