工资由两个公司发放该如何认定？

在工资由两个公司发放的情况下，我们需要从多个方面来进行认定。

首先是劳动关系的认定。劳动关系主要是看劳动者与哪个公司存在实际的用工关系。根据《中华人民共和国劳动合同法》第七条规定，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。用人单位应当建立职工名册备查。如果劳动者接受某一个公司的管理、指挥和监督，为其提供劳动，那么就与该公司建立了劳动关系。即便工资由另一个公司发放，只要实际用工主体明确，劳动关系依然以实际用工情况来确定。例如，劳动者一直在A公司工作，接受A公司的工作安排，虽然工资由B公司发放，但劳动关系仍应认定为与A公司建立。

其次是社保缴纳方面。按照《中华人民共和国社会保险法》第五十八条规定，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。未办理社会保险登记的，由社会保险经办机构核定其应当缴纳的社会保险费。一般来说，与劳动者建立劳动关系的公司有义务为其缴纳社保。如果工资由两个公司发放，但劳动关系只与其中一个公司建立，那么该公司就应该依法为劳动者缴纳社保。如果出现两个公司都未缴纳社保的情况，劳动者可以要求建立劳动关系的公司补缴。

再者是税务方面。依据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例，个人取得的工资、薪金所得应当缴纳个人所得税。当工资由两个公司发放时，两个公司都有代扣代缴的义务。劳动者需要注意的是，自己应将两处取得的工资、薪金所得合并计算应纳税额，并在规定的时间内进行汇算清缴。比如，劳动者在A公司取得一部分工资，在B公司取得另一部分工资，这两部分工资都要合并计算应纳税额，若存在多退少补的情况，要按照规定办理。

此外，如果工资由两个公司发放涉及到劳务派遣等特殊情形，根据《劳务派遣暂行规定》，劳务派遣单位应当依法与被派遣劳动者订立2年以上的固定期限书面劳动合同，按照国家规定和劳务派遣协议约定，依法支付被派遣劳动者的劳动报酬和相关待遇。被派遣劳动者在用工单位因工作遭受事故伤害的，劳务派遣单位应当依法申请工伤认定，用工单位应当协助工伤认定的调查核实工作。也就是说，在劳务派遣中，工资发放、工伤认定等都有明确的规定和责任划分。

总之，工资由两个公司发放时，需要综合多方面的法律规定和实际情况来准确认定劳动关系、社保缴纳、税务等问题，以保障劳动者的合法权益。