合作合同是否可以扣除工资？

首先要明确，“工资”通常是在劳动关系中，劳动者付出劳动后，用人单位依据法律规定和劳动合同约定支付给劳动者的报酬。而合作合同建立的一般是合作关系，并非劳动关系，也就不存在严格意义上的“工资”概念。

在合作关系里，双方的权利和义务主要由合作合同来约定。如果合作合同中明确约定了在某些情形下可以扣除一方的款项，只要该约定不违反法律法规的强制性规定，就是有效的。比如合同约定一方未按要求完成合作事项，另一方有权扣除一定比例的合作款项。这种约定属于双方意思自治的体现。

依据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条规定，当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。书面形式是合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，视为书面形式。这表明合作合同只要符合法定形式，其约定就是受法律保护的。

但是，如果合同中没有相关扣除款项的约定，一方随意扣除另一方的款项，就可能构成违约。根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。被扣除款项的一方可以依据该规定，要求对方承担相应的违约责任。