小产权房遇到拆迁被当违章建筑拆除合法吗

小产权房遇到拆迁被当违章建筑拆除是否合法，要视具体情况而定。

首先要明白什么是违章建筑，违章建筑是指未取得拟建工程规划许可证，在规划区以外建设，违反《土地管理法》《城乡规划法》等相关法律法规的规定动工建造的房屋及设施。

依据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条规定，未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。如果小产权房存在上述违法建设情况，政府有权拆除违法建筑，这种拆除行为就是合法的。

另外，《国有土地上房屋征收与补偿条例》 第二十四条规定，市、县人民政府作出房屋征收决定前，应当组织有关部门依法对征收范围内未经登记的建筑进行调查、认定和处理。对认定为合法建筑和未超过批准期限的临时建筑的，应当给予补偿；认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑的，不予补偿。所以若小产权房经合法认定为违章建筑，拆除合法且没有补偿；若小产权房只是没有房产证，但属于合法建筑，被当作违章建筑拆除就是违法的。

总之，不能一概而论地说小产权房遇到拆迁被当违章建筑拆除是否合法，关键在于小产权房本身是否符合相关建设规划等法律规定，以及是否经过合法的认定程序。