特殊食品经营企业是否应当建立健全食品安全？

特殊食品经营企业是应当建立健全食品安全的。这里所说的特殊食品，是指保健食品、特殊医学用途配方食品和婴幼儿配方食品等有特定保健功能或者特殊营养需求的食品。

从法律依据来讲，《中华人民共和国食品安全法》对食品经营企业的食品安全管理作出了明确规定。其中，特殊食品经营企业作为食品经营主体的一部分，承担着保障食品安全的重要责任。该法要求食品经营企业应当建立健全食品安全管理制度，加强对所经营食品的安全管理。对于特殊食品，由于其受众往往是特定人群，如婴幼儿、病人等，其安全性和质量要求更高。所以，特殊食品经营企业更需要建立健全食品安全管理体系，包括但不限于进货查验记录制度、销售记录制度、食品安全自查制度等。

进货查验记录制度要求企业在采购特殊食品时，要严格检查供货者的许可证和食品合格证明文件等，如实记录食品的名称、规格、数量、生产日期或者生产批号、保质期、进货日期以及供货者名称、地址、联系方式等内容，并保存相关凭证。销售记录制度则保证了特殊食品从企业到消费者手中的流向可追溯。食品安全自查制度促使企业定期对自身的经营条件和食品安全状况进行检查评价，及时发现并消除食品安全隐患。

如果特殊食品经营企业未按照规定建立并执行食品安全管理制度，根据《中华人民共和国食品安全法》的相关规定，将面临相应的行政处罚，如责令改正，给予警告；拒不改正的，处五千元以上五万元以下罚款；情节严重的，责令停产停业，直至吊销许可证。因此，特殊食品经营企业建立健全食品安全不仅是保障消费者健康的需要，也是企业合法合规经营的必然要求。