公司在员工休流产假时扣全勤，申请仲裁会怎样？

在法律上，流产假是女职工应享有的法定假期。全勤奖通常是公司为激励员工全月无缺勤而设置的一项奖励。当女职工因流产按规定休假时，公司扣发全勤奖是否合理，需要结合具体情况和相关法律规定来判断。

根据《女职工劳动保护特别规定》，女职工怀孕未满4个月流产的，享受15天产假；怀孕满4个月流产的，享受42天产假。在产假期间，女职工的生育津贴，对已经参加生育保险的，按照用人单位上年度职工月平均工资的标准由生育保险基金支付；对未参加生育保险的，按照女职工产假前工资的标准由用人单位支付。这意味着女职工休流产假是法律赋予的权利，期间应享受相应的工资待遇。

全勤奖是否属于工资范畴，法律没有明确统一的界定，但从性质上来说，如果全勤奖是工资的组成部分，那么公司在女职工依法休流产假时扣发全勤奖是不合理的。因为女职工休流产假是合法行为，并非无故缺勤。如果公司的规章制度中明确规定，只要当月有请假情况就不发放全勤奖，且该规章制度是通过合法程序制定并向员工公示的，这种情况下可能存在一定争议。但即便如此，该规定也不能违反法律的强制性规定，女职工的合法权益依然受到保护。

如果女职工遇到公司在休流产假时扣全勤奖的情况申请仲裁，首先需要收集相关证据，如劳动合同、工资条、医院的诊断证明、休假申请记录等，以证明自己依法享受流产假以及公司扣发全勤奖的事实。仲裁机构会根据双方提供的证据和具体情况进行审理。如果仲裁机构认定公司扣发全勤奖的行为不合理，会要求公司补发相应的全勤奖。如果公司对仲裁结果不服，可以在规定时间内向法院提起诉讼；女职工对仲裁结果不满意，同样也有权利向法院起诉。