已经登记转让的房屋被判决转让行为无效该怎么办？

当已经登记转让的房屋被判决转让行为无效时，这意味着从法律层面上，该房屋转让自始不发生法律效力，就好像这个转让行为从来没有存在过一样。

首先，关于房屋产权。依据《中华人民共和国民法典》第一百五十七条规定，民事法律行为无效、被撤销或者确定不发生效力后，行为人因该行为取得的财产，应当予以返还。所以，房屋产权应当恢复到转让前的状态。原房屋所有权人可以凭借法院的生效判决，要求不动产登记机构办理产权变更登记手续，将房屋产权重新登记到自己名下。

其次，对于已经支付的房款等款项。如果受让人已经向转让人支付了房款，转让人应当将该款项返还给受让人。同时，如果因转让行为无效给对方造成了损失，有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失；各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。例如，若转让人明知房屋存在纠纷仍进行转让，那么转让人可能需要承担受让人的利息损失等。

再者，可能涉及的其他费用。在房屋转让过程中，可能产生了一些诸如契税、中介费等费用。这些费用的承担也需要根据双方的过错情况来确定。一般来说，如果是因为一方的过错导致转让行为无效，那么过错方可能需要承担这些费用。如果双方都有过错，则可能按比例分担。

最后，若双方对于上述事项无法达成一致意见，可以再次通过协商或者向法院提起诉讼等方式来解决争议，以维护自己的合法权益。