公司因回款差只发部分员工工资是否合法？

公司因回款差只发部分员工工资，这种做法一般是不合法的。

工资是劳动者付出劳动后应得的报酬，公司有按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬的义务。根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十条规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。同时，《中华人民共和国劳动法》第五十条也明确规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

从法律角度来说，公司回款差并不能成为只发放部分员工工资的合法理由。如果公司确实遇到了经营困难，无法按时足额支付工资，按照法律规定，公司应该提前与工会或者职工代表协商，并且按照协商一致的办法来处理工资支付问题。比如，经与本单位工会协商一致，可以暂时延期支付劳动者工资，延期时间的最长限制可由各省、自治区、直辖市劳动行政部门根据各地情况确定。

要是公司没有经过合法程序，随意只发放部分员工工资，劳动者可以先与公司进行沟通协商，要求公司说明情况并及时支付工资。如果协商不成，劳动者可以向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令公司限期支付工资。如果公司逾期仍不支付的，劳动者还可以通过劳动仲裁或者向法院起诉的方式来维护自己的合法权益。在这种情况下，劳动者还可以要求公司按照应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向自己加付赔偿金。