个人所得税扣除是按实发工资还是应发工资？

在计算个人所得税扣除时，通常是按照应发工资来计算的，但这里的应发工资要经过一系列的扣除和调整后，才用于确定应纳税所得额。

应发工资，就是我们在工资条上看到的还没有扣除任何款项之前的工资总额，它包含了基本工资、奖金、津贴等所有收入。而实发工资是在应发工资的基础上，扣除了五险一金、个人所得税以及其他可能的扣除项目后，实际拿到手的工资。

根据《中华人民共和国个人所得税法》第六条规定，居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。这里所说的收入额，其实就相当于应发工资在经过一些必要的扣除调整后的金额。

专项扣除包括居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险等社会保险费和住房公积金等；专项附加扣除包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等支出。

具体的计算步骤是，先确定应发工资，然后减去上述规定的扣除项目，得到应纳税所得额，再根据适用的税率和速算扣除数来计算应缴纳的个人所得税。例如，小张每月应发工资是10000元，他缴纳的五险一金是1000元，有一个子女正在接受全日制学历教育，每月可扣除1000元专项附加扣除，那么他的应纳税所得额就是10000 - 5000（每月减除费用） - 1000 - 1000 = 3000元，再根据对应的税率和速算扣除数算出当月应缴纳的个税。所以，个人所得税扣除的计算基础是经过合理扣除调整后的应发工资相关金额。