离职没有提前申请，公司扣工资这种做法合法吗？

离职没有提前申请，公司直接扣工资的做法通常是不合法的，但存在特殊情况。

首先，从劳动者解除劳动合同的法定程序来看，根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条规定，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。这是为了保障用人单位能够有合理的时间进行工作交接等安排。但这并不意味着未提前通知，用人单位就可以随意扣工资。

其次，若劳动者未提前通知离职，给用人单位造成了经济损失，根据《中华人民共和国劳动合同法》第九十条规定，劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。同时，参照《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。不过，这里有明确的扣除限制，即每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

最后，用人单位若要扣除工资进行损失赔偿，需要承担举证责任，证明其确实因为劳动者未提前申请离职而遭受了经济损失，且损失的数额等情况也需要有相应证据支撑，不能随意克扣工资。

总之，一般情况下离职未提前申请公司扣工资不合法，只有在劳动者给用人单位造成经济损失且符合法定扣除程序和限制时，用人单位才可以在一定范围内要求赔偿并扣除工资。